Al-Mumtaz Blog: April 2015

LAPORAN PRATIKUM GENETIKA DASAR

====CHI-SQUARE TEST (UJI ) ====

Disusun oleh:

Nama : Gunawan
Nim : 1405101050043

Kelompok : 3

Kelas : agroteknologi 01

LABORATORIUM GENETIKA DAN PEMULIAAN TANAMAN

PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI

FAKULTAS PERTANIAN

UNIVERSITAS SYIAH KUALA

2015

KATA PENGANTAR

Assalamu ‘alaikum Wr. Wb

Puji dan syukur kehadirat Allah SWT, yang mana berkat rahmat dan karunia-Nya lah penulis dapat menyesaikan Laporan Pratikum Genetika untuk memenuhi salah satu tugas praktikum mata kuliah Genetika. Tak lupa shalawat dan salam semoga tetap tercurahkan pada Nabi akhir zaman Muhammad SAW, beserta keluarga, para sahabat dan seluruh umatnya.

Penulis mengakui dalam laporan ini mungkin masih banyak terjadi kekurangan dan kesalahan sehingga hasilnya jauh dari kesempurnaan. Penulis sangat berharap kepada semua pihak kiranya memberikan kritik dan saran yang sifatnya membangun.

Mudah-mudahan isi dari laporan pratikum penulis ini dapat diambil manfaatnya oleh semua pihak yang membaca laporan ini. Ucapan terimakasih penulis sampaikan kepada semua pihak yang telah membantu penulis dalam penyusunan laporan ini sehingga laporan ini terselesaikan.

Banda Aceh, 16 April 2015

Penulis

DAFTAR ISI

KATA PENGANTAR………………………………………………………..

DAFTAR ISI………………………………………………………………….

ABSTRAK…………………………………………………………………….

BAB I : PENDAHULUAN………………………………………………….

1.1 Latar belakang........................................................................................

1.2 Tujuan………………………………………………………………….

BAB II: TINJAUAN PUSTAKA…………………………………………...

BAB III :METODE PRAKTIKUM………………………………………...

3.1 Tempat dan waktu……………………………………………………...

3.2 Bahan dan alat………………………………………………………….

3.3 Metode pelaksanaan praktikum………………………………………...

BAB IV : HASIL DAN PEMBAHASAN…………………………………..

4.1 Hasil Pengamatan……………………………………………………....

4.2 Pembahasan.............................................................................................

BAB V : KESIMPULAN……………………………………………………

DAFTAR PUSTAKA……………………………………………………….

LAMPIRAN…………………………………………………………………

ABSTRAK

Metode Khi–Kuadrat (Chi-Square Test) adalah suatu uji nyata yang menentukan apakah hasil observasi menyimpang dari nisbah yang diharapkan, secara kebetulan atau tidak. Tujuan praktikum ini adalah menghitung peluang pada setiap kejadian, menghitung uji Khi-Kuadrat dan menggunakan uji Khi-Khuadrat dalam analisis genetika Mendel. Praktikum ini menggunakan tiga percobaan, percobaan pertama menggunakan dua buah koin dilemparkaan secara bersamaan sebanyak 100xxdan dilihat peluang muncul sisi A dan sisi B. Percobaan kedua sebuah dadu dilemparkan sebanyak 60x dan dilihat peluang munculnya mata dadu 3 atau 5 atau 6. Percobaan ketiga, tiga buah dadu dilempar secara bersamaan dan dilihat peluang munculnya 2 mata dadu secara bersamaan; mata 1,3 dan 5; mata 2, 4 dan 6. Kesimpulan dari praktikum ini adalah data hasil observasi yang kami lakukan tidak semua diterima karena nilai x2 hitung bervariasi dari nilai x2 tabel sehingga ada yang tidak sesuai dengan aturan Khi-Kuadrat (Chi-Square Test). Adanya perbedaan antara data yang diperoleh (observation) dan yang diharapkan (expected) disebabkan karena adanya peluang yang sama pada setiap kejadian.

I. PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang

Sejak dahulu manusia menyadari bahwa orangtua mewariskan ciri-cirinya kepada keturunannya. Anak manusia mirip orang tuanya, domba dan sapi mirip induknya, sementara tanaman gandum mirip dengan tanaman induknya. Manusia juga percaya bahwa sifat-sifat orang tua bercampur dalam keturunannya. Namun, tidak ada orang yang tahu cara kerja pewarisan sifat sampai jawabannya ditemukan oleh biarawan yang bernama Gregor Mendel. Banyak sifat pada tanaman, binatang dan mikroba yang diatur oleh satu gen. Gen-gen dalam individu diploid berupa pasangan-pasangan alel dan masing-masing orang tua mewariskan satu alel dari pasangan gen tadi kepada keturunannya.

Pengetahuan mengenai bahan genetik diawali pada saat Friedrich Miescher mengisolasi nukleat pada tahun 1869 dari inti sel-sel nanah yang kemudian ternyata adalah suatu asam. Sebagai suatu senyawa biologis, nukleat ini terbukti mengandung banyak fosfat. Bertahun-tahun kemudian barulah rahasia molekul yang akhirnya dikenal sebagai asam nukleat ini makin jelas terungkap. Sementara beberapa peneliti mempelajari asam nukleat dari sudut kimiawi, beberapa peneliti lain mempelajarinya sebagai bahan pembawa informasi genetik.

Metode khi-kuadrat adalah cara yang dapat dipakai untuk membandingkan data percobaan yang diperoleh dari persilangan-persilangan dengan hasil yang diharapkan berdasarkan hipotesis secara teoritis. Dengan cara ini seorang ahli genetika dapat menentukan satu nilai kemungkinan untuk menguji hipotesis itu.

Oleh karena itu dilakukan percobaan monohibrid Mendel dengan menggunakan metode khi-kuadrat dengan membandingkan data percobaan yang sesuai dengan hipotesis untuk membuktikan hukum Mendel I berlaku atau tidak dalam kesimpulan yang ditarik pada percobaan yang dilakukan.

1.2 Tujuan

Adapun tujuan pada praktikum kali ini, yaitu:

1. Menghitung X2 untuk menentukan apakah data yang diperoleh cocok atau sesuai dengan teori atau yang diharapkan.

2. Menginterpretasikan nilai X2 yang dihitung dengan table X2

II. TINJAUAN PUSTAKA

Terbentuknya individu hasil perkawinan yang dapat dilihat dalam wujud fenotip, pada dasarnya hanya merupakan kemungkinan-kemungkinan pertemuan gamet jantan dan gamet betina. Keturunan hasil suatu perkawinan atau persilangan tidak dapat dipastikan begitu saja, melainkan hanya diduga berdasarkan peluang yang ada. Sehubungan dengan itu, peranan teori kemungkinan sangat penting dalam mempelajari genetika (Rahardi, 2009).

Teori kemungkinan merupakan dasar untuk menentukan nisbah yang diharapkan dari tipe-tipe persilangan genotipe yang berbeda. Penggunaan teori ini memungkinkan kita untuk menduga kemungkinan diperolehnya suatu hasil tertentu dari persilangan tersebut.Metode chi-kuadrat adalah cara yang dapat kita pakai untuk membandingkan data percobaan yang diperoleh dari persilangan-persilangan dengan hasil yang diharapkan berdasarkan hipotesis secara teoritis. Dengan cara ini seorang ahli genetika dapat menentukan suatu nilai kemungkinan untuk menguji hipotesis itu (Ali.2011).

Untuk mengevaluasi suatu hipotesis genetik diperlukan suatu uji yang dapat mengubah deviasi – deviasi dari nilai – nilai yang diharapkan menjadi probabilitas dari ketidaksamaan demikian yang terjadi oleh peluang. Uji ini harus pula memperhatikan besarnya sampel dan jumlah peubah (derajat bebas) (Anonim. 2012).

Uji ini dikenal sebagai uji X² (Chi Square Test). Dalam ilmu genetika, kemungkinan ikut mengambil peranan penting. Uji Chi Square Test (X²) bertujuan untuk mengetahui apakah data yang didapat dari hasil pengamatan sesuai dengan nilai atau nilai ekspektasinya yang juga dapat diartikan bahwa hasil observasinya sesuai dengan model atau teori. Ukuran seberapa besar deviasi tersebut disebut dalam formula atau rumus berikut :

k (Oi-Ei)²

X² = å -------------

I=1 Ei

Oi = Jumlah individu yang dialami pada fenotipe ke-I

Ei = jumlah individu yang diharapkan atau secara teoritis pada fenotipe ke-I

å = Total dari semua kemungkinan nilai (Oi-Ei)²/Ei untuk keseluruhan fenotipe

(Suryo. 2003).

Biasanya nilai kemungkinan 5% dianggap sebagai garis batas antara menerima dan menolah hipotesis. Apabila nilai kemungkinan lebih besar dari 5%, penyimpangan dari nisbah harapan tidak nyata. Jika data X² hitung lebih kecil dari X² tabel (X²hitung < X²Tabel) maka data diterima dan data pengamatan sesuai dengan model atau teori. Sedangkan kalau X² hitung lebih besar dari X² tabel (X² hitung > X² Tabel) maka data di tolak dan data pengamatan tidak sesuai dengan model atau teori (Suryati, 2007).

III. BAHAN DAN METODE PRAKTIKUM

3.1 Tempat dan Waktu

Adapun tempat praktikum yaitu di Laboratorium Genetika dan Pemuliaan Tanaman Fakultas Pertanian Universitas Syiah Kuala pada hari kamis tanggal 9 April 2015 pukul 10:00 WIB.

3.2 Alat Dan Bahan

Alat dan bahan yang digunakan yaitu:

1. Kacang buncis merah dan putih

2. Kantong atau kotak

3. Petridish

3.3 Cara Kerja

Adapun langkah-langkah kerja yang dapat kita lakukan dalam praktikum kali ini yaitu:

1. Dicampurkan 200 biji jagung kuning dan 200 biji jagung putih, diaduk dan ditempatkan di dalam satu kotak.

2. Diambil sampel dari campuran di atas pada langkah kerja pertama sebanyak 1 petridish.

3. Dipisahkan dan dihitung yang kuning dan putih.

4. Dicatat data anda dilembar kerja dan dihitung jumlah yang diharapkan berdasarkan jumlah sampel dan populasi jagung kuning dan putih.

5. Dilengkapi tabel lembar kerja anda dan dihitung X2.

IV. HASIL PENGAMATAN

Tabel 1. Perhitungan X² untuk sampel yang diambil dari populasi 200 jagung kuning dan 200 jagung putih.

Fenotipe	Pengamatan (observasi = O)	Harapan (expected=E)	Deviasi (O-E)	(O-E)2	(O-E)2/E X²
Kuning	14		3.5	12.25	1.16
Putih	17	10.5	6.5	42.25	4.02
Total	21	21	10	54.5	5.18

Dan X² tabel=3.84. Karena X² hitung lebih kecil dari X² tabel (5.18>3.84) maka devisiasi terjadi karena kebetulan belaka dengan demikian data tidak dapat diterima dan tidak sesuai dengan model atau teori.

Tabel 2. Perhitungan X² untuk acara 1 (Mandel I), 20 x

Fenotipe	Pengamatan (observasi = O)	Harapan (expected=E)	Deviasi (O-E)	(O-E)2	(O-E)2/E X²
Kuning	9	10	-1	1	0.1
Putih	11	10	1	1	0.1
Total	20	20	0	2	0.2

Dan X² tabel=3.84. Karena X² hitung lebih kecil dari X² tabel (0.2<3.84) maka devisiasi terjadi karena kebetulan belaka dengan demikian data dapat diterima dan sesuai dengan model atau teori.

Tabel 3. Perhitungan X² untuk acara 1 (Mandel I) 40 x

Fenotipe	Pengamatan (observasi = O)	Harapan (expected=E)	Deviasi (O-E)	(O-E)2	(O-E)2/E X²
Kuning	22	20	2	4	0.2
Putih	18	20	-2	4	0.2
Total	40	40	0	8	0.4

Dan X² tabel= 3.84. Karena X² hitung lebih kecil dari X² tabel (0.4 <3.84) maka devisiasi terjadi karena kebetulan belaka dengan demikian data dapat diterima dan sesuai dengan model atau teori.

Tabel 4. Perhitungan X² untuk acara 1 (Mandel I) 60 x

Fenotipe	Pengamatan (observasi = O)	Harapan (expected=E)	Deviasi (O-E)	(O-E)2	(O-E)2/E X²
Kuning	32	30	2	4	0.13
Putih	28	30	-2	4	0.13
Total	60	60	0	8	0.26

Dan X² tabel=3.84. Karena X² hitung lebih kecil dari X² tabel (0.26<3.84) maka devisiasi terjadi karena kebetulan belaka dengan demikian data dapat diterima dan sesuai dengan model atau teori.

Untuk data dari praktikum sebelunnya

Tabel 6. Perhitungan X² untuk acara 3 (Pobabilitas), 30x

Fenotipe	Pengamatan (observasi =O)	Harapan (expected=E)	Deviasi (O-E)	(O-E)2	(O-E)2/E X²
Gambar	18	½ x 30 = 15	3	9	0.6
Angka	12	½ x 30 = 15	-3	9	0.6
Total	30	30	0	18	1.2

Dan X² tabel=3,84. Karena X² hitung lebih kecil dari X² tabel (1.2<3,84) maka devisiasi terjadi karena kebetulan belaka dengan demikian data dapat diterima dan sesuai dengan model atau teori.

Tabel 7. Perhitungan X² untuk acara 3 (Pobabilitas), 40x

Fenotipe	Pengamatan (observasi =O)	Harapan (expected=E)	Deviasi (O-E)	(O-E)2	(O-E)2/E X²
3G-0A	8	1/8 x 40 = 5	3	9	1.8
2G-1A	12	1/8 x 40 = 5	7	49	9.8
1G-2A	12	1/8 x 40 = 5	7	49	9.8
0G-3G	8	1/8 x 40 = 5	3	9	1.8
Total	40	20	20	116	23.2

Dan X² tabel=7.82. Karena X² hitung lebih kecil dari X² tabel (23.2>7.82) maka devisiasi terjadi karena kebetulan belaka dengan demikian data tidak dapat diterima dan tidak sesuai dengan model atau teori.

Tabel 8. Perhitungan X² untuk acara 3 (Pobabilitas), 48x

Fenotipe	Pengamatan (observasi =O)	Harapan (expected10=E)	Deviasi (O-E)	(O-E)2	(O-E)2/E X²
4G-0A	6	1/16 x 48 = 3	3	9	3
3G-1A	10	1/16 x 48 = 3	7	49	16.3
2G-2A	13	1/16 x 48 = 3	10	100	33.3
1G-3A	12	1/16 x 48 = 3	9	81	27
0G-4A	7	1/16 x 48 = 3	4	16	5.3
Total	40	15	32	255	84.9

Dan X² tabel=9.49. Karena X² hitung lebih kecil dari X² tabel (84.9>9.49) maka devisiasi terjadi karena kebetulan belaka dengan demikian data tidak dapat diterima dan todak sesuai dengan model atau teori.

4.2 Pembahasan

Pada praktikum kali ini percobaan yang dilakukan adalah untuk mengetahui apakah suatu data dari hasil pengamatan yang didapat sesuia dengan nilai atau nilai ekspektasinya dan apakah hasil dari data suatu observasi yang diperoleh sesuai dengan model atau teori yang telah ditentukan.

Pada hasil pengamatan yang telah diperoleh untuk populasi 200 jagung kuning dan jagung putih kali ini, didapat nilai hitung (nila dari hasil pengamatan) lebih kecil dari nilai tabel (nilai pada tabel taraf 5 %). Sehingga hasil hipotesis yang didapatkan tidak dapat diterima. Berikut merupakan uraian dari hasil perhitungan hitung pada populasi 200 jagung kuning dan jagung putih:

dB = n-1 = 2-1 = 1